Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF550Q7Z398 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms