Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APTXQ7Z2E3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APTXQ7Z2E3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms