Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX8Q7RTT4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms