Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8DQ7L1W4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC8DQ7L1W4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8DQ7L1W4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8DQ7L1W4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms