Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PDZD4Q76G19 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms