Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS27LQ71UM5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27LQ71UM5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27LQ71UM5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms