Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPUQ71F23 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPUQ71F23 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms