Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
USP43Q70EL4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP43Q70EL4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP43Q70EL4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP43Q70EL4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP43Q70EL4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP43Q70EL4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP43Q70EL4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP43Q70EL4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP43Q70EL4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP43Q70EL4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP43Q70EL4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP43Q70EL4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP43Q70EL4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP43Q70EL4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms