Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT7Q6ZNI0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT7Q6ZNI0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms