Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM72Q6ZMU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms