Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP12Q6UXS9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms