Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARM1Q6SZW1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SARM1Q6SZW1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARM1Q6SZW1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms