Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD5Q6GMV2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMYD5Q6GMV2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMYD5Q6GMV2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms