Protein–RNA interactions for Protein: Q69YG0

TMEM42, Transmembrane protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM42Q69YG0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM42Q69YG0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms