Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEF1DP3Q658K8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEF1DP3Q658K8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEF1DP3Q658K8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EEF1DP3Q658K8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms