Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPATA1Q5VX52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPATA1Q5VX52 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms