Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF9Q5VWM5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF9Q5VWM5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms