Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACHD1Q5VU97 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACHD1Q5VU97 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms