Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC7Q5VTL7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FNDC7Q5VTL7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC7Q5VTL7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms