Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF20Q5VT98 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF20Q5VT98 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF20Q5VT98 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF20Q5VT98 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF20Q5VT98 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF20Q5VT98 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms