Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM78Q5T7P6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms