Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDLRAP1Q5SW96 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAP1Q5SW96 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms