Protein–RNA interactions for Protein: Q5PT55

SLC10A5, Sodium/bile acid cotransporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A5Q5PT55 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC10A5Q5PT55 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC10A5Q5PT55 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC10A5Q5PT55 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC10A5Q5PT55 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC10A5Q5PT55 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC10A5Q5PT55 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A5Q5PT55 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC10A5Q5PT55 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A5Q5PT55 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms