Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSL3PQ5NE16 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms