Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLC27A3Q5K4L6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC27A3Q5K4L6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC27A3Q5K4L6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms