Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
AMER1Q5JTC6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AMER1Q5JTC6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AMER1Q5JTC6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms