Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC178Q5BJE1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC178Q5BJE1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC178Q5BJE1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms