Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDK2Q58EX2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK2Q58EX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms