Protein–RNA interactions for Protein: Q53ET0

CRTC2, CREB-regulated transcription coactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC2Q53ET0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRTC2Q53ET0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC2Q53ET0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms