Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO43Q4G163 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO43Q4G163 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms