Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3H1Q32P28 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H1Q32P28 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms