Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms