Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPPQ16740 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLPPQ16740 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms