Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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