Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZFHX3Q15911 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZFHX3Q15911 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZFHX3Q15911 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZFHX3Q15911 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZFHX3Q15911 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ZFHX3Q15911 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZFHX3Q15911 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZFHX3Q15911 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZFHX3Q15911 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZFHX3Q15911 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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