Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEBPEQ15744 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEBPEQ15744 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms