Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9A3R2Q15599 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms