Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRLQ15198 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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