Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF4Q15080 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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