Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIP1Q15025 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIP1Q15025 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNIP1Q15025 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNIP1Q15025 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIP1Q15025 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
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