Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
NCAPD2Q15021 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCAPD2Q15021 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms