Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HERPUD1Q15011 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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