Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPHQ15003 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
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