Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1I3Q14994 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1I3Q14994 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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