Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SSPNQ14714 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSPNQ14714 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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