Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
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TNFAIP1Q13829 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFAIP1Q13829 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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TNFAIP1Q13829 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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TNFAIP1Q13829 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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TNFAIP1Q13829 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFAIP1Q13829 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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TNFAIP1Q13829 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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