Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SQSTM1Q13501 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms