Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XRCC4Q13426 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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