Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.48■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
GRIN2BQ13224 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GRIN2BQ13224 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
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