Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3BQ13214 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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